NextSeq2000 (Illumina)

V okviru infrastrukturnega kohezijskega projekta ELIXIR-SI RI-SI-2 smo dobavili novo raziskovalno opremo NextSeq2000 (Illumina), ki bo omogočala velik napredek na področju aktualnih omskih raziskav, povezanih s COVID19, osebno medicino ter z drugimi področji ved o življenju.

Informativno prijavo za naročilo storitve za delo na navedeni aparaturi lahko oddate tukaj .

Razpis “Executive Masters in Management of Research Infrastructures”

Odprt je razpis za “Executive Masters in Management of Research Infrastructures”, ki se bo začel septembra 2021.

 

Več informacij najdete na spletišču programa.

 

Središče ELIXIR namerava podpreti člane vozlišč ELIXIR, da se udeležijo posameznih modulov tega programa.

 

Če vas program zanima, nam prosim javite svoj interes po epošti elixir@mf.uni-lj.si najkasneje do 30.6.2021.

Vabilo na dogodek: Raziskovalna infrastruktura ELIXIR-SI za vede o življenju

VABILO na dogodek

Raziskovalna infrastruktura ELIXIR-SI za vede o življenju

 

v sredo, 16. junija 2021, ob 10:30 uri preko spleta.

Povezava do predvajanja v živo

Na dogodku bomo predstavili najnovejšo omsko in z njo povezano raziskovalno infrastrukturo vozlišča ELIXIR-SI.

 

 

ELIXIR je prioritetna evropska raziskovalna infrastruktura za informacije na področju ved o življenju. Mreža vozlišč ELIXIR ima središče v Angliji (ELIXIR Hub) in nacionalna vozlišča po državah članicah (ELIXIR Nodes). Sodelovanje vsake države je potrjeno s strani parlamenta in odgovornega ministrstva.

 

Na dogodku bodo prisotni rektor Univerze v Ljubljani, prof. dr. Igor Papič, ministrica za izobraževanje, znanost in šport, prof. dr. Simona Kustec, g. Andrew Smith, predstavnik koordinatorja evropske mreže ELIXIR, Velika Britanija ter vodilni predstavniki partnerjev vozlišča ELIXIR-SI. Gostitelj dogodka je Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta, prof. dr. Igor Švab, dr. med, dekan.

 

Uvodni del dogodka z novinarsko konferenco bo trajal od 10.30-11.30, po kratkem odmoru pa bo sledil predstavitveni del projektnih partnerjev, ki bo trajal predvidoma med 12.00-14.00

 
 Nadgradnja raziskovalne infrastrukture ELIXIR-SI se financira s pomočjo sredstev Evropskega sklada za regionalni razvoj in MIZŠ.

Dodatne informacije o dogodku najdete tukaj.

Izobraževanje za delo z LIDAR sistemom na brezpilotnem letalniku

V sredo in četrtek, 21 in 22.4.2021 od 8.30 dalje, bo na online povezavi (https://global.gotomeeting.com/join/355175725) potekalo izobraževanje za delo z LIDAR sistemom (RIEGL miniVUX-2UAV) na brezpilotnem letalniku, dobavljeno v okviru kohezijskega projekta ELIXIR-SI RI-SI-2.

 

V sredo bo vsebina razdeljena v dva sklopa, in sicer:

  1. RiACQUIRE/RiPARAMETER programska oprema za pripravo zajema podatkov ter
  2. Obdelava podatkov in postprocesiranje podatkov s programsko opremo POSPAC in RiPROCESS.

V četrtek bo izobraževanje potekalo na praktičnem primeru obdelave konkretnih podatkov.

Predavanje bo potekalo v angleščini in ga bo izvedel proizvajalec opreme RIEGL Laser Measurement Systems GmbH.

Izobraževanje za delo z novo laboratorijsko opremo – Cytation 5 (BioTek)

V četrtek, 22.4.2021 od 10.00 do 16.00 bo na Univerzi v Mariboru potekalo izobraževanje za delo z novo laboratorijsko opremo – Cytation 5 (BioTek), dobavljeno v okviru kohezijskega projekta ELIXIR-SI RI-SI-2. Zaradi epidemoloških razmer prosimo, da se zainteresirani udeležijo online izobraževanja na povezavi.

 

Predavanje, v katerem bodo predstavljene zmožnosti sistema ter specifične aplikacije (yH2AX, oksidativni stres), bo vodil dr. Igor Gak (Biotek Field Application Scientist). Predavanje bo potekalo v angleščini in ga bo organiziralo podjetje Kemomed d.o.o. kot dobavitelj opreme.

Odprta prijava na tečaj Genome Assembly and Annotation

Odprli smo prijavo na napredni virtualni tečaj Genome Assembly and Annotation (GAA), ki bo potekal od ponedeljka, 3. maja, do petka, 7. maja 2021. Tečaj je namenjen raziskovalcem, ki bi radi spoznali postopek sestavljanja (assembly) in anotacije genoma z bioinformatskimi računalniškimi orodji, vse od vhodnih surovih podatkov do sestavljenega in označenega genoma. Tečaj bo obsegal predavanja in praktične vaje v ukazni vrstici Linux.

Na tečaj se lahko prijavite na tej povezavi. Registracija je odprta med 30.3. in 19.4.2021. Število udeležencev je omejeno, selekcijo med prijavljenimi kandidati pa bodo opravili organizatorji. Če ste bili izbrani, boste izvedeli 26. aprila. Izbrani udeleženci bodo dobili dostop do spletne strani z vsemi potrebnimi materiali, informacijami in povezavami za tečaj. Po tečaju bodo udeleženci prejeli potrdila o udeležbi.

  • Datum: ponedeljek, 3. maj 2021 – petek, 7. maj 2021 – vsak dan od 09:00 CEST do 16:00 CEST
    • Tečaj bo potekal virtualno preko videokonferenčne povezave.
    • Pogoji za udeležbo: pred začetkom tečaja GAA je potrebno obvezno opraviti kratki virtualni tečaj ukazne vrstice Linux. Vsak prijavljeni na tečaj GAA bo dobil dostop do virtualnega tečaja Linux (podrobnosti si lahko preberete v registracijskem obrazcu za tečaj GAA na povezavi zgoraj).
    • Omejitev števila udeležencev: organizatorji bodo sprejeli največ 25 udeležencev, s tem da lahko iz vsakega vozlišča ELIXIR prihajata največ po 2 udeleženca (razen iz Norveške, kjer je tečaj odprt tudi za udeležence iz NORBIS). Udeležence bodo izbrali organizatorji. Udeleženci morajo imeti napredno znanje ukazne vrstice Linux.
  • Udeležba na tečaju je brezplačna.

Učitelji: Christophe Klopp (ELIXIR Francija), Lucile Soler, Mahesh Binzer-Panchal, Nima Rafati, Tomas Larsson, Henrik Lantz (vsi ELIXIR Švedska) in Erik Hjerde (ELIXIR Norveška).

Smernice za FAIR delitev predkliničnih farmakoloških podatkov

Delitev predkliničnih podatkov v farmacevtski industriji lahko vodi do večje obveščenosti pri izbiri strategij za klinično testiranje, s tem pa zmanjša čas in stroške za registracijo novega zdravila. Projekt eTRANSAFE je pripravil smernice za lažjo delitev podatkov o varnosti in neželenih učinkih v predklinični farmakologiji. Več o projektu eTRANSAFE in o smernicah si lahko preberete na tej povezavi.