Mesec: september 2020

Izobraževanje za delo na sekvenatorju Nanopore GridION

Spoštovani člani vozlišča ELIXIR Slovenija!

Vabimo vas na izobraževanje za delo na sekvenatorju Nanopore GridION, ki je del infrastrukture ELIXIR-SI. Oprema je dobavljena v okviru kohezijskega projekta ELIXIR-SI RI-SI-2.

Prva dva dneva (5. 10. in 7. 10.) sta dopoldan namenjena teoretični predstavitvi tehnologije Nanopore za aplikacije RNA in DNA, tretji dan (9. 10.) pa analizi podatkov. Teoretični del bo v celoti dostopen vsem zainteresiranim preko aplikacije ZOOM.

Praktični del bo izveden 5. 10. in 7. 10. popoldan na Medicinski fakulteti UL, v prostorih CFGBC IBK, Zaloška 4. Obsegal bo testna sekvenciranja RNA pod video nadzorom strokovnjakov Nanopore.


Organiziran bo za omejeno število udeležencev, poleg skrbnikov opreme predvsem za raziskovalce z izkušnjami s tehnologijo Nanopore.

Podroben program in povezava sta navedena v vabilu.

Vljudno vabljeni!

Mikrobiološka skupnost ELIXIR ima nova orodja za analizo v okolju Galaxy

Mikrobiološka skupnost ELIXIR (Microbial Community) se ukvarja z razvojem orodij za analizo in načrtovanje mikrobnih procesov. Orodja, ki so jih razvili raziskovalci iz skupnosti, so sedaj na voljo v orodjarni Galaxy za sintetično biologijo in metabolni inženiring. Skupnost pripravlja tudi novo implementacijsko študijo o uporabi podatkovnih nizov FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) v smiselnih matematičnih modelih.

Objavljeno poročilo ScienceEurope in OECD o optimizaciji uporabe nacionalnih raziskovalnih infrastruktur

ScienceEurope in Organizacija za ekonomsko sodelovanje in razvoj (Organisation for Economic Co-operation and Development – OECD) sta objavila skupno poročilo o izboljšanju uporabe nacionalnih raziskovalnih infrastruktur. Poročilo obravnava stanje infrastrukture v 12 državah članicah OECD (Avstralija, Kanada, Francija, Nemčija, Madžarska, Japonska, Južna Koreja, Nizozemska, Norveška, Švica, Velika Britanija in ZDA). Poročilo je dostopno na tej povezavi .

Začela se je ECCB – Evropska konferenca za računalniško biologijo

Med 31. avgustom in 8. septembrom poteka 19. Evropska konferenca za računalniško biologijo (European Conference on Computational Biology – ECCB). Zaradi epidemije Covid-19 dogodek letos poteka virtualno, organizira pa ga ELIXIR Španija, ki bi prvotnem načrtu moral gostiti dogodek v živo v Barceloni. ECCB 2020 je forum za druženje in povezovanje znanstvenikov z vsega sveta, ki se ukvarjajo z vrhunskim raziskovalnim delom na področjih bioinformatike in računalniške biologije. ECCB 2020 je največje letno znanstveno srečanje na svojem področju v Evropi. Program srečanja si lahko ogledate na tej povezavi .

Če koga zanima udeležba na dogodku, se lahko še vedno registrira (tukaj je povezava do registracijskega obrazca). Ob registraciji je potrebno plačati kotizacijo – višina kotizacije je v razponu od 10 do 90 evrov in je odvisna od države, akademskega statusa ter članstva v Mednarodnem društvu za računalniško biologijo (International Society for Computational Biology – ISCB), obstaja pa tudi popust za skupinsko registracijo. Cenik je objavljen na registracijskem obrazcu .